製品概要

inte:Ligand社により開発されたPharmacophore ActivityProfilerは,Pharmacophoreデータベースを科学的に証明された基礎として,化合物構造からリガンドプロファイルを迅速かつ容易に得ることを可能にするツールです.

Figure. Activity Profiling出力例(ヒートマップ)

 

inte:Ligand社のPharmacophore データベースは,化学的特徴に基づく3Dファーマコフォアの集まりです.ファーマコフォア構築における長年の経験に基づき,品質が注意深く確認されています.このデータベースには,生物活性を有する有機分子の構造情報だけでなく,タンパク質-リガンド複合体構造から求めたモデルも含まれています.

現在,10,000を超えるファーマコフォアモデルを利用可能です.それらは,主要な薬効分類に由来した,臨床的に意義のあるユニークな300の薬理学的標的を対象としており,その薬効分類は,例えば,抗生物質、心血管、内分泌、胃腸、免疫学、代謝、神経学、腫瘍崩壊性、腎臓 - 泌尿器系および呼吸器系の薬剤などが挙げられます.

本データベースは,LigandScout Knime Extensionからシームレスに利用することができます.

 

リファレンス

  • Parallel Screening: A Novel Concept in Pharmacophore Modelling and Virtual Screening T. M. Steindl, D. Schuster, C. Laggner, T. Langer J. Chem. Inf. Model., 46, 2146-2157 (2006) DOI 10.1021/ci6002043
  • High Throughput Structure-based Pharmacophore Modeling as A Basis for Successful Parallel Virtual Screening T. M. Steindl, D. Schuster, G. Wolber, C. Laggner, T. Langer J. Comput. Aided Mol. Des., 20, 703-715 (2006) DOI 10.1007/s10822-006-9066-y
  • Pharmacophore Modeling and Parallel Screening for PPAR Ligands P. Markt, D. Schuster, J. Kirchmair, C. Laggner, T. Langer J. Comput. Aided Mol. Des. 21, 575-590 (2007) DOI 10.1007/s10822-007-9140-0